《神界托爾2》的故事接著《複仇者聯盟》。
不過電影一開始並沒有從托爾或地球開始，而是講述了一個關於黑暗精靈的故事。
在遙遠的時代，黑暗精靈獲得了一個神物以太粒子。
入侵了阿斯加德，奧丁率領眾神將其擊退，並奪取了以太粒子。
將其封印在阿斯加德裡。
而後畫麵一轉，托爾作為這部電影的主角正式登場。
他帶著宇宙魔方和洛基回到了阿斯加德。
前者被妥善保管，後者被關押。
雖然洛基不是奧丁的親生兒子，但其畢竟是神王之子的身份。
不可能處死，隻能關押。
奧丁勸說托爾讓他忘記在地球上的女友簡·福斯特。
但托爾並不想放棄簡。
隨著托爾的思念，鏡頭來到了地球。
由於長期得不到托爾的消息，簡在家人和朋友的安排下和一名男子在餐廳裡用餐。
此時她的好友前來告訴她，她的儀器收到了一些特殊的信號。
她連忙結束約會和好友一起前往異常地點。
突然掉入了一個神秘空間。
在這裡她被一種黑色的粒子纏繞，融為一體。
以太粒子泄露了。
此時阿斯加德的奧丁發現了以太粒子泄露的事情，於是派遣托爾前往地球調查。
正好遇到蘇醒的簡從空洞中出來。
見到托爾，簡走過去就是啪啪兩巴掌。
第一巴掌是想要確定托爾是不是真的。
第二巴掌是埋怨他這個負心漢，這麼久了都不來找自己。
托爾發現簡融合了以太粒子於是將其一起帶到阿斯加德，尋找解決的方法。
此時蟄伏的黑暗精靈發現以太粒子重新現世，於是派遣偽裝人員進入了阿斯加德。
他們通過釋放牢房中的囚犯在阿斯加德製造混亂。
並在洛基的提醒下破環了阿斯加德的防護罩。
黑暗精靈大軍直撲融合了以太粒子的簡而來。
此時王宮裡沒有太多的守衛，奧丁在前線對抗黑暗精靈大軍。
黑暗精靈首領在王宮的一處房間裡找到了簡。
托爾的母後，阿斯加德的王後弗麗嘉立刻和首領戰在一起。
原本她以為都要勝利了，卻被因為戰鬥經驗缺乏被首領偷襲殺死。
此時托爾趕了回來，但弗麗嘉已經無法挽回了。
首領見托爾回來，無法奪取以太粒子於是下令撤退。
不久後阿斯加德為弗麗嘉舉辦了一場葬禮。
哪吒作為天庭的使者前來吊唁。
儀式結束後，托爾找到了哪吒讓他幫自己一個忙。
聽完托爾的計劃，哪吒陷入了思考。
不一會兒後回答道“我作為天庭的使者，我不可能幫你，而且還要提醒你這個計劃太簡陋了，我們掌控不住。”
“但我作為你的兄弟，我會幫你這個忙。”
“太感謝了，我的朋友。”
得到哪吒的幫助後，托爾又找到了洛基，說服他和自己一起行動。
不一會兒哪吒帶著簡來和兩人彙合。
簡見到洛基就給了他一巴掌，“為了紐約。”
“我喜歡她。”洛基並沒有生氣，反而笑著說道。
此時哪吒見到洛基，對托爾說道“你弟弟是個極度不穩定的人。”
“所以我才要叫上你。”
托爾不在意，哪吒也不繼續詢問了。
四人一起乘坐飛船來到黑暗世界。
洛基和托爾演了一出戲讓首領取出了簡體內的以太粒子。
此時托爾和隱藏的哪吒同時衝出對以太粒子使用雷電和火焰攻擊。
想要摧毀它。