神奧地區的一處港口，一艘自關東出發即將到達目的地的船隻，正在時刻準備著靠邊停船的動作。
在海平麵上，飛翔著的一隻隻姆克兒與姆克鳥，這樣的景象，無不在映照著神奧地區其神奇寶貝的特色。
隨著遊輪順利靠岸，一位留著褐色頭發的青少年緩緩走下了甲板。
“神奧地區，總算是到了。”大木鶴微微一笑，拿出地圖朝著真砂鎮走去。
這次的神奧之行，大木鶴總共就帶了耿鬼、代歐奇希斯、金屬怪和赫拉克羅斯等四隻精靈。
而之所以要先去真砂鎮，是因為臨行前老爺子教代了大木鶴，讓他替自己去拜訪一下學術界的前輩——山梨博士。
就在大木鶴前往真砂鎮的途中，一位騎著自行車的女孩，也從家鄉雙葉鎮出發向真砂鎮疾馳而去。
而在距離港口的數十海裡外，一位帶著皮卡丘的少年，搭乘的遊輪也在不斷靠近神奧地區。
“皮卡丘，我們就快到神奧地區了。阿鶴那個家夥，居然不等我就跑來了。這次的聯盟大會，我們一定不能輸給他哦！”
帶著皮卡丘的少年，自然是小智了。自從得到了代歐奇希斯，覺醒了波導之力後，讓他的自信心變得更加地爆棚了。
“皮卡皮卡～”（傻多喜，我知道了。）
另一邊，下了遊輪的大木鶴花了三個小時的步行時間，總算是來到了位於真砂鎮山梨研究所。
“叮咚～”
“哢嚓！”
“請問你是新人訓練家嘛！”開門的，是山梨博士的一位助手。
不過當他看到大木鶴時，有些疑惑地詢問道。
“哦！你誤會了。我是來自關都真新鎮的大木鶴，受大木博士所托來拜訪山梨博士的。”
“原來是這樣啊！山梨博士眼下不在研究所裡。不過他有來電，明確了今天會回到研究所裡。你要是不急的話，可以在研究所裡等待一下。”
“謝謝，那就麻煩你們了。”
大木鶴道謝後，就跟隨博士助手進入了研究所。
在這裡，大木鶴看到了神奧地區，新人訓練家挑選的禦三家。
頑皮好動的小火焰猴，個性驕傲的波加曼，以及性格敦實的草苗龜。三隻性格各異的精靈，看到大木鶴這個陌生人後，表現出的態度也不儘相同。
小火焰猴的好奇，波加曼的自信（它把大木鶴，當成新人訓練家了。）草苗龜的平靜（遲鈍）。
雖然大木鶴也很想擁有它們，但一想到這些精靈都是有主之物，大木鶴便放棄了心中的想法。
不過現在不行，不代表之後自己的旅行時，不會碰到野生的禦三家。
時間緩慢流逝，中午大木鶴是在研究所內吃的。
但在新人禦三家吃飯時，現場的小火焰猴與波加曼發生了衝突。
原因就是，小火焰猴在吃掉了自己的食物後，又將魔"抓伸進了波加曼的食盒裡。
然後，本就水火不容的兩隻精靈。加上小火焰猴的挑釁，使得發火的波加曼對著小火焰猴發動了攻擊。
“咯咯～”（沒打著、沒打著。）小火焰猴靈敏地躲過了攻擊，順便再次挑撥著波加曼的神經。
失去了理智的波加曼，開始進行無差彆的攻擊。
資料、書籍、以及其他物品，扔的地上都是。
而小火焰猴在挑釁了一下波加曼後，就飛身離開了研究所。
怒氣衝天的波加曼，自然也是連忙跟了上去。
“這下遭了啊！研究所裡的東西都亂掉了，
“哢嚓。”
“什麼遭了啊！”研究所大門被人打開，一位頭發花白的老者，帶著一位少女走進了研究所。
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