不僅有賞銀，還有賞官，大兵所至之處，或敵人堅壁相距，或大列陣相迎，有能挺身先登，以及越眾衝鋒者，應各依立功等第，授予守備、千把總等官。至於先躍敵船立功者，應各依船大小等第，授以都司、守備、千把總等官，並各給賞銀有差，以示鼓勵。
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除了這些外，朱以海仍強調首級軍功賞賜。
大明向來注重首功製，洪武年間，沿海出現倭亂，朱元璋給出的軍功賞賜標準是凡總旗軍士弓兵生擒一人者，賞銀十兩，斬首一級八兩，民人生擒賊一人銀十二兩，斬首一級十兩。
後來朱棣時期，連連出征漠北，更注重首功，他擬定的軍中賞罰號令，明確規定，哨馬生擒一賊，賞銀三十兩。斬獲首級一顆，賞銀二十兩。
明宣宗時，南方蠻賊作亂，朝廷激勵將士剿賊，出台新政策，斬賊首三顆及以上，軍階升一級，斬首兩顆及以下，俘虜一兩人、斬殺從犯，隻給財物賞賜，不升軍階。
土木堡之變後，軍功記首，更是成為明軍主要激勵製度。
明憲宗時，獎勵製度更全麵。
首先，按殺敵地域而給不同獎勵，首功分四等，一等是寧夏、大同等地的北虜，斬獲首級一顆就可官升一級，二等是遼東女真，斬獲首級兩顆可官升一級，三等是陝西、四川等地的番苗蠻賊，斬獲首級三顆可官升一級。四等是內地反賊，斬獲首級六顆可官升一級，四等功都以三級為上限，超出部份隻給予物質賞賜，不升官。
其次，按殺敵性彆、年齡不同區彆獎賞，除北虜外，苗蠻、女真、反賊三等功中，婦女、幼男的首級不作為升官依據，隻做物質賞賜依據，至於北虜，壯男、幼男、婦女的首級均做為升官依據，不同在於，若首級屬於壯男升官為實授，若首級屬於幼男、婦女隻授予署職，即代理官職。
並且軍官的獎賞與部下斬首數量掛鉤，把總、指揮等軍官，若領軍五百，部下每斬首五顆可升一級，若領兵千人，部下每斬首十顆可升一級，其餘以此類推，升級上限依舊為三級，都指揮使以及上的，最多署職兩級。
大明經曆二百多年，首功製度越來越重要，甚至出現同命不同價的情況。
首功製好處是比較直觀，以人頭為準，簡單直接，但缺點是容易出現濫殺邀功，甚至是殺良冒功，甚至是軍人之間賣首級功等情況。
由於首級成為軍士升遷和賞賜的唯一依據，士兵普遍染上濫殺的惡習；但戰爭並不是常態化的事件，即使發生戰爭，也很可能拿不到人頭，貪欲大增的士兵往往濫殺充數，殺邊境夷民、殺敵軍降將、殺部落幼男等現象屢禁不止。萬曆年間，有文臣上疏揭露：延鎮邊境上的夷民基本上都已經歸順明朝，但戍邊將士為了追求軍功，衝入夷民居住地，大肆屠戮，殘暴和血腥可見一斑。更有甚者，在戰場上割掉戰友的首級，擊殺被敵軍擄去的國民邀功。
濫殺、殺良冒功、買功賣功，都是明軍中的嚴重問題，甚至還有戰場爭首內鬥的情況。
但對於如今的朱以海來說，明軍不能戰，兼之韃虜、內賊等各方勢力嚴重威脅，他不但得建立一支直屬於自己的禁衛禦營，不僅要靠厚餉養軍，還得有較完善和豐厚的功賞製度激勵士兵。
所以儘管不少大臣認為朝廷原來那一套功賞製度有問題，尤其是首級功賞有問題，但朱以海仍然堅持，並且正式下旨擬定了一套紹天朝的戰功賞賜製度，不僅有攻城攻、衝鋒功、水戰功這些，也還有如偵察功，以及斬首功、繳獲功等等詳細規定。
在以前，蒙古人首級最值錢，然後是建州女真，再是苗蠻，最後是內賊，朱以海調整了一下，現在是滿州韃子最值錢，也就是八旗滿州，包括八旗滿州裡的蒙古人、朝鮮人、漢人等，接著是八旗蒙古、八旗漢軍，再然後是清軍綠營，再是苗蠻，再是內地反賊，再是山賊土匪。
朱以海新擬的軍功製度比較複雜，首先強調的還是集體軍功，然後是個人軍功，同時注重首級軍功。
比如說按敵我雙方兵力對比，以少擊多，破城、破陣的戰鬥為上陣，雙方力量相當的為中陣，以多擊少的為下陣，然後再根據對敵殺獲率，將殺獲達到四成以上的為上獲，二成的為中獲，一成以下的為下獲。
如此上陣上獲功勞最大，下陣下獲軍功最小，又要根據士兵的表現再分為三等功，
上陣上獲的第一等可得軍功五轉，上陣中獲、中陣上獲的第一等為四轉，而下陣下獲不分等，均為一轉。
此外，又設立跳蕩功，先鋒功等。
這兩個功相比起一般的三等功，相當於特等功之類的了，比如跳蕩功非常嚴格，臨陣對寇，矢石未交，先鋒挺入，陷堅突眾，賊徒因而破敗者，為跳蕩，這得是衝鋒破陣者才行，而且，有嚴格數量限製。
破賊陣不滿萬人，則跳蕩功不得超過十人，若破萬人以上，則每一千人加一人，其先鋒第一功，所敘不得過二十人。
俘虜一萬人以上，其頭首一人準跳蕩功，一千人以上，準第一等例，賊數不滿千人，量差等處分。