隨後的半個小時，除了差不多抵達山頂遺跡的小智和小葵，其餘人都遭到了黑夜魔靈驅逐，回到了研究所。
早就回來報信的莎莉娜和小光，也從山梨博士口中得知，前幾天，山頂遺跡的挖掘工作中，有工作人員不小心挖出了一個深不見底的山洞，有幾名考古員稱那是通往靈界的入口。
得知事件的起末後，莎莉娜和小光也快步朝著山洞遺跡靠去，山梨博士也帶著人緊隨其後。
與此同時。
小智和小葵也來到了存放徽章獎牌的遺跡。
小葵看著那排列整齊的獎牌，興奮道“小智，看樣子好像我們的第一誒！”
突然一陣莫名的笑聲從旁傳來。
“這邊……這邊……”
聽到動靜的兩人側頭看去，隻見那個小女孩飄到一個深邃的洞穴前，對著小智他們招手。
“奇怪，那邊有什麼嗎？”小葵疑惑道。
小智道“小葵你往後退，那可不是什麼正常人。”
“誒，不是正常人？”
小葵有些疑惑地看向小智，她有點搞不明白到底是什麼情況。
也就在這時，那隻黑夜魔靈從旁邊飛了過來攔在小智他們麵前。
“是黑夜魔靈！”小葵緊張道。
“放心，它並沒有惡意，沙奈朵，你幫忙把小葵送回研究所。”
“沙奈！”
沙奈朵將手搭在小葵的肩膀上，緊接著身形一閃再次出現時，小葵已經不見了。
“瑪夏多、達克萊伊，你們去協助黑夜魔靈製服那個家夥。”
小智的話音剛落，兩道黑影瞬間出現在小女孩身後，緊接著同時出手用能力將那小女孩定在原地，黑夜魔靈見狀也毫不客氣扔出兩團磷火，燒得那小女孩不得不撤去形體。
沒等它再次凝聚形體，小智便用波導和超能力將其搓成一一團黑色氣體。
那洞窟也在這時，那洞窟突然亮起暗紫色光芒，一股強大的吸力要將小智他們往洞窟內吸去。
小智當即撐起波導護盾隔絕吸力，上下打量一番後，猜測道“這破洞該不會是連通騎拉帝納老巢的吧？”
“但也不對啊，關於靈界的傳說和反轉世界好像沒多少聯係。”
看到小智對著靈界通道上下打量，黑夜魔靈不由開口“oni……”（波導使者，拜托你將這個靈界通道破壞掉！）
“好。”
小智捏著的那團黑氣用一個後仰跳投，將其扔回靈界通道後，直接用波導和超能力混合起來施展封印術，將靈界通道徹底封印。
為了防止有人再次將通道打開，小智讓皮卡丘、沙奈朵、伊布同時用招式將洞穴炸垮。
做好這一切後，莎莉娜他們也找來了。
“小智！”
黑夜魔靈也沒有過多交流，緩緩退去轉眼就消失了。