天啟七年以來，朝廷花費數載時間，重新構建三受降城體係，山西行都司，大寧行都司，形成北疆第一條邊防線。
遼東至甘肅九鎮，構建第二道邊防線。
兩條邊防線構成，徹底恢複洪武朝北疆雙條邊防線的戰略。
朝廷攻克遼東，使朝廷東北疆域重新東北抵日本海、外興安嶺，北方覆滅套寇，降服朵顏三部，喀喇沁，土默特，讓北疆疆域從明長城重新北達陰山北麓。
唯獨西域尚退守嘉峪關，未能恢複哈密衛，西南退守雲南境內，尚未達到緬甸和暹羅北境，東南尚未收複安南。
尚未恢複在中南半島的三宣六慰，卻占領南陽群島，及新洲島。
依照朱由校規劃，花費一年時間重建關西七衛，兩年後，西北疆域擴張至鹹海。
東南方麵，兩年覆滅安南，屆時，從安南和雲南出兵，東北兩路進攻緬甸和暹羅北境。
相較西境，北境的擴張，朱由校更關注中南半島，南陽群島，新洲島，印度半島，非洲南端，乃至海洋對岸的大陸。
當前軍改結束，朝廷經營重點依然是大明內部。
京城內，十萬京營形成五師五旅的強軍，同時，李過的龍武軍，賀人龍的武衛軍和曹變蛟率領赤甲軍遼東鐵騎合並，形成三師三旅六萬精銳，曹變蛟，馬科率領的龍武軍，李過，賀人龍率領武衛軍。
祖大弼率領虎賁軍，左良玉率領的燕山軍，孟喬芳率領的四衛軍，盧象升率領的天雄軍，滿桂的幽州鐵騎進行合並，形成三師三旅的精銳，孟喬芳統領神武左軍，祖大弼統領神武右軍，左良玉統領虎賁左軍，盧象升統領虎賁右軍。
邊軍，因軍鎮地理險易，敵軍強弱各不同，設總兵一名，領兩到五師，副總兵一名，領一旅到兩師，設遊擊，參軍各一人，各領一旅或數旅。
總兵為正兵，負責隨警策應、防秋擺邊、諸鎮配合等。副總兵為奇兵，負責待報赴援、設伏防守、長年防守等。參將為援兵負責各路配合、諸兵合作、應援他鎮、防秋擺邊等。遊擊為遊兵，負責戍守本鎮，援助他鎮，入衛京師等。
和平時，總兵，副總兵，參將，遊擊互不隸屬，戰時，副總兵，參將，遊擊自發歸總兵轄製。
九邊軍鎮形成以營兵為核心，以正、奇、援、遊兵馬為主力，上下相維，左右配合，故而保衛大明江山的北疆防線。
京營，五師五旅，設都督一名，領三師，都督同知兩人，各領一師，都督僉事五人，各領一旅。
龍武軍，武衛軍，左右神武軍，左右虎賁軍，三師三旅，設都督一名，領兩師，都督同知一人，領一師，都督僉事三人，各領一旅。
和平時期，在京城操練，戰時，出京作戰，京營，親衛六軍隸屬於樞密院管理。
故而，京營，龍武軍，武衛軍，左右神武軍，左右虎賁軍，挑選精銳，統一號令，合計四十六萬，使京城逐步恢複到永樂朝巔峰狀態。
形成京師皆宿重兵，畿內外當天下之半，實現內重外輕的軍事狀態。
同時，朱由校對諸軍統帥進行調整，以免形成私軍。
各省諸軍，駐軍，朱由校參照朝廷鎮城、路城、衛城、所城和堡城五級城防體係，分駐各鎮戍邊，依所轄地域大小、遠近和險易，因地設官，因官設兵。
普通軍堡駐紮一部，而山西得勝堡則駐紮一營，普通衛城駐紮兩營，而比較重要的衛城，譬如四大衛城，天津衛，威海衛，金山衛，鎮海衛，各駐紮三營。
大朝會。
朱由校率先戶部尚書蘇茂相統計秋稅，派內閣劉鴻訓，刑部尚書張三謨，統計局薛國觀，錦衣衛嚴查秋稅貪汙受賄。
旋即，公布軍改方案，要求樞密院連同百官查漏補缺。
最後，朱由校將教學從禮部單獨拎出來，設教育部，研究，推廣，刊印天文氣象，數學物理，醫學醫藥，農學農政，地理科技，化學化工等學問，書籍。
總領大明官學，私學，負責府學，州學，鄉學，縣學、村學及私人建立的私塾，學院。
三道政令結束，朱由校在乾清宮召見北直隸總督秦王朱誼漶，應天巡撫常延齡，順天巡撫史永安，山西巡撫尹伸，山東巡撫李枟，河南巡撫劉遵憲，江西巡撫郭增光，浙江巡撫朱一馮，廣東巡撫李逢節，福建巡撫熊文燦，陝西巡撫徐大化，甘肅巡撫李精白，四川巡撫尹同皋，貴州巡撫王在晉，雲南巡撫許成名，廣西巡撫侯良柱，偏沅巡撫閔洪學，鄭崇儉擔任黑龍總督，盧象升擔任吉林總督,洪承疇擔任遼寧總督，湖廣總督楊文嶽，兩廣總督孫傳庭，雲貴川黔閔夢得。
此間，乾清宮聚集大明所有封疆大吏。
百官躬身向朱由校行君臣之禮，朱由校吩咐劉若愚為百官賜座，看茶。
殿內，秦王為首的封疆大吏，有點不理解皇帝為何突然召集各省巡撫，總督回京。
按照太祖規定，地方官吏每三年朝覲一次，時間定為辰、戌、醜、未年份的十二月二十五日到京?。
當前乃壬申年，更未到年末，皇帝突然召見，必有要事。
朱由校麵孔浮現濃濃笑意“諸卿臨危受命，奔赴各省赴任，數年間，勤勤懇懇，兢兢業業，在各省多有貢獻，堪稱國之肱骨。
當前，朝廷諸將成功化解外部威脅，開始對外攻伐，然而，大明內部災情越演越烈，故而，朕召集諸卿進京，商議災情事宜。”
皇帝肯定自身所作所為，百官神色歡喜，又齊齊向朱由校行禮。
太祖朝起，朝廷製定限製地方官員任期製度，規定文職官員任期為三年，武職官員則為四年。
然而，亦有部分官吏任職多年，甚至一任官吏留任十年以上。
這麼做容易滋生腐敗問題，而限製任期可以避免官員權力過度集中和濫用職權。
早前內憂外患，百廢待興，皇帝特意將文官一任期延長到五年，給予百官一任或兩任任期，使各省封疆大吏有充足時間貫徹自身政策，恢複各省經濟。
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