接下來的一段日子裡，直樹幾乎每天的大多數時間都是在寶可夢研究所中度過的。
首先是有關哲爾尼亞斯的研究，直樹從哲爾尼亞斯口中了解到了神獸和普通寶可夢的區彆。正常來說現實和在遊戲之中是一樣，神獸的種族值比普通的寶可夢更加高一些，並不會展現出完全碾壓的力量差距。
不過神獸擁有一種從外界提取力量的特殊能力，它們可以將能量儲存在自己的身上，在戰鬥時拿出來使用。這種經過長時間積累的雄厚能量基本上不可能有普通的寶可夢能夠憑借本身的力量匹敵。神獸會耗儘這種能量的唯一可能性就是遇到另一隻敵對的神獸，並且雙方使用這種能量對波。
哲爾尼亞斯和伊裴爾塔爾現在差不多都是將這股能量消耗到所剩無幾的情況。
想要恢複這種能量的方法唯有重新來過，依靠時間的沉澱。
而哲爾尼亞斯這些天似乎發現了新的方法，那就是從直樹身上獲取一些能量。在哲爾尼亞斯看來，ega進化的過程實際上就是寶可夢從訓練家身上獲得能量的過程，超進化手環和超進化石是這個過程的介質，而哲爾尼亞斯身為神獸不需要這個介質。
最關鍵的是直樹服用了阿爾宙斯改造藥水乙型使得他擁有了近乎無窮無儘的能量，隻要待在直樹邊上，哲爾尼亞斯就能比平時更快地累積能量。而且這個過程中還不用擔心會對直樹產生不好的影響。
雖然說不是什麼便捷的方法，但終歸也是一件好事。至少在下一次遇到伊裴爾塔爾的時候，哲爾尼亞斯這邊能夠占據近乎絕對的優勢。
說完哲爾尼亞斯這邊的事情，直樹做的最主要的事情就是幫助布拉塔諾博士研究超進化，畢竟能夠和多隻寶可夢使用出超進化，直樹可謂是卡洛斯第一人了，布拉塔諾博士毫不客氣地就把直樹拉過來當作工具人了。
至於為什麼布拉塔諾博士會知道這個，純粹是因為之前挑戰映雪道館的時候使用過被多羅巴看見了，然後多羅巴又告訴的布拉塔諾博士。
直樹不知道布拉塔諾博士到底研究出來了個什麼，反正他自己覺得超進化這個東西是挺玄學的，除了需要超進化手環和超進化石極其對應的寶可夢之外，直樹也說不準到底還有什麼必要條件。大概真的就隻能說訓練家與寶可夢之間的羈絆這類的東西了。
超進化對戰係統在這個時候還隻是剛剛起步，就算是聯盟高層的人都還沒能完全普及，直樹挑戰道館的時候也就隻有可爾妮和得撫兩人擁有超進化手環和超進化石，四大天王的話直樹就不知道了，至少在遊戲中他們是沒有的。
正因為是剛剛起步，就算是直樹這樣雲裡霧裡的說法在布拉塔諾博士看來也是十分重要的經驗。甚至直樹還能在布拉塔諾博士新發表的論文之中占據一個署名的位置。
除了這些之外，直樹自己本身也發表了自己作為一名研究助手的第一篇論文《性格對寶可夢能力和口味的影響》。這篇論文在佐藤徹和布拉塔諾博士的共同推動下名動一時，許多寶可夢訓練家，尤其是寶可夢培育家都知曉了佐藤直樹這個名字。
其實這篇論文算得上是遊戲黨或多或少都知道一些的東西，性格會影響寶可夢的能力，就比如固執的寶可夢比正常情況下物攻更高、特攻更低，獲得物攻努力值更容易，獲得特攻努力值更難。
至於性格影響口味的話大概隻有嘗試過華麗大賽玩法的人可能會有所了解，總的來說的話就是攻擊對應辣味，防禦對應酸味，特攻對應澀味，特防對應苦味，速度對應甜味。同樣以固執性格舉例，固執性格的寶可夢通常來說會更喜歡辣味，不喜歡澀味。當然這也不是絕對的，就比如直樹的圖圖犬性格是爽朗，但是它並沒有特彆喜歡甜的東西，不過它確實不喜歡澀味。