嘉靖的上諭很快就通過兵部的急遞抵達南京和督撫行轅，首先就是南京的內外守備了，馮保常年在宮內，當然知道嘉靖是什麼樣的人，誰敢要他的老臉，他就要誰小命，這次倭寇是讓嘉靖臉麵儘喪了，要是明軍不能在戰場上找回這個臉麵，那嘉靖就要從臣子們那裡找回臉麵了。
當年庚戌之變時，兵部尚書兼督團營丁汝夔呈《備邊十要》及“退虜長策”十餘牘，但是嘉靖厭惡兵事，根本不予理睬，授意嚴嵩將他的奏疏扣下，同時嚴嵩建議丁傳令諸將不許輕易出戰，韃靼得以肆掠京城周邊八日，民間皆歸罪於丁汝夔。
等到俺答退兵之後，嘉靖和嚴嵩就將一切罪責都推到丁汝夔身上，以禦寇無策、守備不嚴將丁汝夔斬首。杖責都禦史屠僑、刑部侍郎彭黯、大理卿沈良才各四十，將一切責任都推到丁汝夔和沿邊督撫身上去。
馮保深知，一旦官軍不能將這股倭寇殲滅，找回這個場子，嘉靖是肯定要那南直隸的一眾官員泄憤的，一旦他們互相攀咬起來，自己這個南京內守備未必能獨善其身。
馮保趕緊來到守備官廳，詢問徐鵬舉有沒有什麼舉措，徐鵬舉就將徐天賜叫他做的事情告訴了馮保，馮保說道：“眼下還是去信張經，問問他在前線，到底是什麼情況，還要什麼支持。”
徐鵬舉點頭照辦，在嘉興的張經、蘇州的趙文華、鬆江的唐順之等人也都收到了嘉靖的上諭和楊博的命令，眼下嘉靖算是給了南直隸一眾官員戴罪立功的機會，等到漕運總兵臨淮侯李庭竹也率自己麾下的水師趕到江陰後，趙文華以浙直總督的名義召集唐順之、胡宗憲、俞大猷、戚繼光、李庭竹等一眾督撫總兵官，商議軍機。
蘇州府，趙文華的行轅設在察院場，坐在上首的趙文華說道：“陛下的上諭和兵部的嚴令，想必各位已經看過了吧，這仗怎麼打？諸位可有什麼建議。”
說實話，嘉靖的上諭還有自己義父嚴嵩的書信都讓趙文華倍感壓力，這次倭寇占據崇明，確實是大明前所未有之事，之前倭寇就算屢敗官軍，但是還沒到占據大明的州縣，這下趙文華這個剛剛上任的浙直總督顏麵全無。
俞大猷說道：“部堂、兩位都憲，末將以為，對付這股倭寇，有緩急兩步，所謂急，就是倭寇占據崇明已經有些時日，掠奪的錢糧恐怕已經消耗的差不多了，倭寇近日必會再次劫掠，我軍應該趁機重創倭寇，以報陛下之膺寄。所謂緩，就是克複崇明，以報陛下。”
趙文華聽出來了，俞大猷從始至終都沒提全殲這股倭寇的事情，說明俞大猷根本沒想過這事，能收複崇明，重創這股倭寇，斬首個幾百上千的，就算對得起萬壽帝君發的餉了。
俞大猷還補充道：“此戰水戰為先，陸戰次之，水戰所急在巨艦，艦不巨，則衝敵為艱，我軍中福船甚少，蒼山等小船多，水戰於我，難於取勝。”
這點得到了前來支援的漕運總兵臨淮侯李庭竹的讚同，這次李庭竹帶來了戰船五百，但是都是八槳、五槳、叭喇唬等小船，因為漕運總兵麾下的戰船在運河中使用，本就都是小船，他們平日裡也就是打打水匪而已，到大江之上作戰，還是第一次。
李庭竹也說道：“趙部堂，兩位都憲，本爵麾下的水師，都是在運河之上作戰的，若是剿滅水匪等，尚算得力，若是與倭寇大戰，恐怕沒有勝算。況且江陰背後，就是鎮江、南都，不可不備啊！”
李庭竹說的確實是這個道理，楊博也是病急亂投醫，不管是否適合，把附近的水師都一股腦調來了，但是南京方向始終是顯得薄弱的，趙文華將目光看向了胡宗憲和戚繼光，此次就屬浙江水師實力最為強大，水師之事，當然要看他們二位了。