決定了前往香薰市的小智一行人，準備在出發前去一趟布拉塔諾博士的研究所。希特隆也重新歸隊，四人小隊重新集結。（研究所將要再次被破壞了！）
布拉塔諾博士熱情的歡迎小智四人，剛好今天他要進行烈咬陸鯊超進化數據的研究，用的當然是小智贈送的超級進化石和鑰石。布拉塔諾博士在小智和卡露乃對戰後，就開始注重培養他和烈咬陸鯊的羈絆。
突然間一聲巨大的聲響，研究所再次被破壞，一個喵喵機器人闖了進來。不用想也知道是火箭隊三人組！
他們抓住了烈咬陸鯊以及超進化石和鑰石就要跑，小智怎麼可能讓他們如願呢！
“皮卡丘，鐵尾！”
皮卡丘一發鐵尾就切斷了抓住烈咬陸鯊的觸手，超進化石落在了烈咬陸鯊的手裡，進化鑰石落在了布拉塔諾博士的手裡。
這時火焰雞假麵帶著超級火焰雞也趕到了這裡，超級火焰雞使用的火焰踢形成的火焰將喵喵機器人包裹住。利莫內大叔喊道“布拉塔諾博士，就是現在！”
布拉塔諾道“好，現在就來收集數據！烈咬陸鯊我相信你，超級進化！”
布拉塔諾博士手裡的鑰石與烈咬陸鯊身上的超級進化石相互呼應，一道強光之後超級烈咬陸鯊登場！
“烈咬陸鯊，使用劈開破壞那台機器！”
瞬間喵喵機器人就變得四分五裂，見勢不對的火箭隊三人準備要跑。
“破壞死光！”
破壞死光轟向火箭隊，一聲爆炸後，火箭隊三人再次起飛！
“好討厭的感覺啊！”
“索南斯！”
事情解決後，布拉塔諾博士準備向火焰雞假麵道謝但是他和火焰雞卻已經離開了。
小智一行人告彆了布拉塔諾博士就離開了密阿雷市，他們以香薰市為目標持續著旅行！
布拉塔諾博士在小智他們離開後，它來到了利莫內大叔的電器店中，剛才火焰雞假麵離布拉塔諾博士最近，他聞到了熟悉的機油味。利莫內大叔經常幫研究所進行設備維修等工作，所以他對這股味道是很熟悉的！
布拉塔諾博士到的時候，利莫內大叔正在修理洗衣機，看到布拉塔諾博士來問道“博士，是機器出問題了嗎？”
布拉塔諾笑道“不，好濃鬱的機油味啊！不管什麼時候聞都另有一番風味呢！其實我今天過來是有件事想要拜托你，能將你的超級火焰雞來幫助我的研究嗎？”
利莫內大叔沒想到他的身份竟然被布拉塔諾博士識破了，尷尬的伸出了手和布拉塔諾博士的手握在了一起。
離開了密阿雷市的小智四人，目前他們正在一條小溪旁吃午飯，希特隆在上次分彆後還特意研究了菜色，料理的手藝有所提高，連寶可夢食物都做的很好吃，寶可夢們都大口大口的吃著。尤其是哈力栗，三兩下就將寶可夢食物吃完了還意猶未儘，就將視線落在了頑皮熊貓麵前的食物上。
頑皮熊貓抓住了哈力栗想要偷吃的手，將自己的寶可夢食物移了移，哈力栗卻不放棄，搶奪間，哈力栗撞翻了咚咚鼠的寶可夢食物。食物的怨恨是很強大的，咚咚鼠當即就用了電擊將哈力栗給擊飛。
黏美龍主動將自己的寶可夢食物遞給了哈力栗和咚咚鼠，讓兩隻重歸於好。
這時一隻喇叭芽跑到了黏美龍麵前，黏美龍伸出手興奮樣子，兩隻寶可夢很顯然認識。
一個大叔也走了過來，欣慰道“真的是你啊，好久不見黏黏寶不對，現在應該是黏美龍了！”
小智問道“請問你認識我的黏美龍嗎？”
大叔道“原來你遇到了一個好的訓練家，要不然就不會這麼快就進化了！大家好，我叫賢藏，是前麵不遠處濕地的管理員，黏美龍進化前一直都生活在那裡！”
小智四人自我介紹後，小智才問道“當初我遇到黏黏寶時期的黏美龍的時候，它是被一隻首席天鵝帶出去的，後來我了解到黏美龍的家鄉似乎被什麼入侵了，請問到底是發生了什麼事？”
黏美龍聽到小智提起這件事，雖然它已經變強不是當初的黏黏寶了，但是想起來還是不由的恐懼，當時被欺負的太厲害，都留下了陰影了！
小智安慰道“黏美龍，放心我在你身邊！”
黏美龍相信小智，點了點頭平靜了下來。
隨後小智四人就跟著賢藏大叔來到了濕地，看著眼前熟悉的故鄉，有開心也有失落。
濕地地區居住的寶可夢應該是種類最多的，但是放眼看去卻沒有看到任何的寶可夢，小智釋放出波導之力，才察覺到不是沒有寶可夢而是都躲了起來，都不敢露麵。
賢藏這才歎了一口氣將事情的前因後果都說了一遍，道“這片濕地有一口湧泉，它湧出的泉水具有治愈寶可夢身心的療效！之前黏黏寶和眾寶可夢們都過著和樂的生活，可是因為這口湧泉卻引發了一場紛爭！”
那天，一隻花潔夫人帶著眾多的蟲係、毒係的寶可夢們對濕地進行了入侵，黏黏寶本來都準備逃跑了，可是看到同伴被攻擊就返回準備去幫忙，但卻被花潔夫人使用的月亮之力給打飛了出去，幸好被首席天鵝帶離了濕地，之後就遇到了小智。
莎莉娜道“怪不得那個時候黏黏寶會這麼害怕咚咚鼠了。”
希特隆問道“那其他的寶可夢們呢？都被趕出去了嗎？”
賢藏搖了搖頭道“沒有，它們現在都還在濕地上，隻是被趕到了濕地的邊緣地帶。”
黏美龍難受的低下了頭，小智道“賢藏先生，入侵的隻有毒係和蟲係的寶可夢嗎？”
賢藏點了點頭，道“是的。”
小智道“那麼這場入侵事件應該有前因才對，野生寶可夢具有很強的地盤意識，要不是發生了什麼事，是不會主動去入侵其他寶可夢生活的地方的。”
賢藏道“這麼說來也是！”
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