捕獵遊標上可以顯示出野生寶可夢們的狀態，可使用的技能和其他各種各樣的狀態，來幫助寶可夢巡護員們找出可以協助他們的野生寶可夢們。
很快，眾人就在荊棘的中心處找到了受傷的時拉比。
小智的皮卡丘也在這裡，它已經先找了很多桃桃果過來來時拉比吃。
這隻時拉比看起來比較單純，沒有受到過壞人的傷害，小智幾人一說是來救它的，時拉比就非常開心地相信了。
然後乖乖地躺在那裡接受小剛和日向給它的治療。
到了晚上，傷勢恢複的時拉比沉沉地睡了過去。
“已經沒問題了，隻要讓時拉比睡一晚，明天應該就能恢複了，這些荊棘，應該就是時拉比為了保護自己而製造出來的吧。”日向道。
第二天早上，小智一行人被時拉比那歡快的笑聲給叫醒了。
時拉比已經完全恢複了，在天空中自由自在地飛翔著。
看著恢複健康的時拉比，小智等人非常開心。
之後，時拉比把全部的荊棘都給消除掉，使得森林恢複了往日的樣子，然後就跟小智等人告彆，消失在了原地，可能是去到彆的時空了吧。
事情解決了，小智一行人也與日向告彆，繼續前往淺紅市。
途中，他們路過了一家忍者學園，在這裡體驗了一天的忍術體驗入學。
小剛也收服了一隻野生的還是一個的小寶寶盆才怪。
它現在還太小了，沒辦法吃東西，要小剛拿著奶瓶喂它喝牛奶。
大家都說小剛看起來像一個奶爸一樣，很成熟穩重，很值得信賴。
但小剛卻不喜歡這個評價，因為他還要去追美麗的大姐姐呢，怎麼就成爸爸了。
之後，小智一行人來到某個城鎮，在這裡，小遙遇見了一位叫做阿國的老奶奶，她一直在這裡等待著她的丈夫回來。
可從她的孫女久美子口中，小遙得知，阿國老奶奶的丈夫阿勇早在幾十年前離開不到一個月後，就傳來了在事故中喪生的消息，隻是阿國老奶奶一直不願意相信。
之後，小遙在車站裡意外地見到了阿國老奶奶的懷表，穿越了時空，穿越到了幾十年前，阻止了阿勇的離開。
回到自己的時空之後，小遙竟然成功地改變了曆史。
因為小遙的那顆蛋馬上就要孵化出寶可夢來了，寶可夢中心的喬伊小姐為了保險，請來了寶可夢蛋的撫養家來幫忙。
而這個撫養家，正是沒有離開的阿勇，當然了，現在已經成了一個老爺爺了。
跟在後麵的還有阿國老奶奶和久美子。
小遙驚訝地問了一下，卻發現阿勇從未離開過這個城鎮。
這個時候，小遙才相信，自己確實是成功地改變了這段曆史。
後來，在阿勇老爺爺的幫助下，小遙的那顆寶可夢蛋成功孵化出了一隻伊布。
小遙抱著可愛的伊布，愛不釋手。
這下子，三人組都有了一個寶寶寶可夢，
小智的是波克比回歸了，當然，已經進化成波克基斯了。
小剛收服了一隻盆才怪寶寶，
小遙的寶可夢蛋孵化出了一隻伊布寶寶。
告彆了喬伊小姐和阿勇老爺爺，阿國老奶奶，小智一行人在不久後來到了對戰管道附近的一家寶可夢中心裡。
休息一晚上之後，第二天早上，小智元氣滿滿地起床，準備去對戰管道挑戰。
這時，盆才怪突然哭了起來，應該是肚子餓了。