告彆了莉拉和亞希達，小智一行人往尼比市的方向前進。
走到一片山區的時候，小智突然看到天空當中出現了一片極光。
小智眉頭緊皺，按理說，極光應該是在極地地區才會出現的，怎麼會出現在這個地方。
並且，眾人發現，像是手機啊，寶可夢圖鑒啊，精靈球什麼的，全部都不能用了，像是受到了什麼嚴重的乾擾。
皮卡丘的情況也很不對勁。
與此同時，小智一行人還遇到了趕來這裡調查的寶可夢巡護員日向。
從日向的口中，小智一行人得知，這附近出現了地磁異常的現象，已經持續一周的時間了。
突然，天空中出現了一陣驟變，一隻代歐奇希斯突然出現在天空中，但很快就消失不見了。
日向帶著小智一行人來到附近的一家寶可夢中心裡商討對策。
寶可夢中心這裡的各個係統也都受到影響，無法正常使用。
“以前代歐奇希斯曾經在拉魯斯市出現過，負責研究的倫多博士在報告中指出，那隻代歐奇希斯是跟著隕石一塊從太空中過來的。”日向道。
“這個我們知道，畢竟之前拉魯斯市的代歐奇希斯危機，就是靠小智才解決的。”小遙道。
“什麼，原來幫助了倫多博士的那群少年，就是小智你們啊。”日向驚訝道。
“十年前，確實有隕石墜落在這附近一帶的山區裡，聽說還造成了一場大爆炸。”喬伊小姐道。
在詢問喬伊小姐得到隕石墜落的位置之後，日向跟小智一行人便來到了一座洞窟裡麵，在洞窟的深處，果然看到了一顆巨大的隕石。
緊接著，代歐奇希斯突然出現，小智急忙派出噴火龍，壓製住了代歐奇希斯。
而日向此時也查明了原因。
因為最近正是太陽黑子爆發的時期，通過檢測，這附近地磁異常時的波形與受到太陽風影響時的波形是一致的。
太陽風的影響使得那顆隕石產生了反應，連帶著引發了地磁的異常。
而隕石的異常反應，又使得代歐奇希斯痛苦不已。
知道原因之後，小智直接讓噴火龍摧毀了那顆隕石，事件就此平息。
代歐奇希斯離開了，地磁也恢複了正常，事情圓滿結束。
告彆了日向，小智一行人來到了一座小鎮，這裡有一個黃金樹才怪的傳說。
之後，小智一行人從一個叫做欽也的男生口中得知，那隻黃金樹才怪，其實是欽也的寶可夢。
因為欽也為了讓樹才怪克服怕水的弱點，就拿樹才怪去做實驗，結果不小心把樹才怪變成了全身金黃，樹才怪也因此而討厭欽也，逃走了。
了解到事情的原委之後，小智一行人幫助欽也找到了那隻黃金樹才怪，然後又幫助他們和好。
欽也早就後悔拿樹才怪去做實驗了，早已研究出了讓樹才怪變回來的方法。
樹才怪變回原來的樣子之後，這個黃金樹才怪的傳說也就不了了之了。