旌旗蔽江，無數戰船逆流而上。
桓玄聞報劉裕沿江而來，不由大驚，急忙分兵派將，一麵令水軍順流而下迎敵，一麵自率步騎，自江陵迎擊。
五月十七日，兩軍於崢嶸洲相遇，展開大戰。當時桓玄軍占據兵力優勢，且恃上淩下，本應輾壓對方；但因軍無戰心，故在劉毅進攻下迅速潰敗。
桓玄歎道：果不出我所料耶！
遂令焚毀輜重乘夜逃走，步兵都督郭銓向劉毅投降。桓玄於是敗回江陵，命令收拾金銀珠寶數十車輛，再挾晉安帝西走。
部將馮該攔住馬頭，力勸桓玄整兵再戰。
桓玄不肯，欲投奔梁州刺史桓希。當時人心已離，桓玄隻與心腹數百人出發。
車駕到城門之時，隨行中人有欲暗殺桓玄，但射之未中，於是彼此廝殺，亂作一團。桓玄乃奉安帝司馬德宗，太後何法倪及皇後王神愛車駕，勉強登船。
此時環顧左右，身邊大臣隻有卞範之及屯騎校尉毛修之，引數百禁軍，跟隨在側。
桓玄欲到梁州治所漢中，毛修之誘使入蜀，桓玄隻得聽從，於是溯江而上。
當時正值寧州刺史毛璠去世，益州刺史毛璩派侄孫毛佑之及參軍費恬等，領數百人送毛璠靈柩至江陵，於五月二十六日在江陵城西枚回洲與桓玄相遇。
二人痛恨當初桓溫攻滅蜀國，此時聞說是桓玄到來，又見其落單，豈有不痛打落水狗之理？於是進攻桓玄，箭矢如雨，桓玄寵臣丁仙期、萬蓋等為桓玄擋箭而死。
益州督護馮遷跳上桓玄坐船，抽刀向前。
桓玄急拔下頭上玉飾遞給馮遷，令其觀看，並威嚇道：此乃禦用之物也。你是甚麼人，竟敢弑殺天子？
馮遷一掌將其頭飾擊落入水，說道：搞笑至極！我隻殺天子叛賊，此處何有天子！
再複一刀，將桓玄剁翻，跌入江中。桓玄遂被殺害，享年三十六歲。
馮遷等便奉毛璠靈柩東還江陵，置其部從餘人不問，更不知晉安帝便在江中船上。
桓玄從弟桓謙聞其兄被殺凶信，便在舟中為兄舉哀，上諡號為武悼皇帝。桓玄首級則被毛佑之等傳至建康，掛於城頭大桁之上示眾。
百姓看見之後無不欣喜，奔走相告，如同元宵觀燈盛況。
當初穆帝皇後何法倪及安帝皇後王神愛被桓玄棄於巴陵，殷仲文當時以收集散卒為名，將二後移駐彆船，並趁機背叛桓玄，迎請二後回於建康。
劉裕聞報桓玄已死，遂引兵還於建康，設立留台，總率百官商議，奉迎乘輿，收桓玄宗族在於建康者，儘行剿滅誅殺。
於是命尚書王暇率百官西至江陵，奉迎晉安帝乘輿，王暇欣然領命西往。司徒王謐與眾臣商議，欲推劉裕領揚州牧，劉裕固辭不肯受，乃以王謐錄尚書事，領揚州刺史。
劉裕自為鎮軍將軍，都督三吳八州諸軍事，徐州刺史，領軍將軍。又以劉穆之為堂邑太守，總諸京師政務，儘皆委任之。
劉穆之亦竭節儘誠，無所遺隱。當時晉政寬馳，綱紀不立，豪族陵縱，小民窮蹙，其時劉穆之斟酌時宜，隨方矯正。
劉裕以身垂範，威禁內外，百官皆肅然奉職，不盈旬日而建康風俗頓時改惡為美。
當初王謐為桓玄佐命元勳，曾親手逼晉帝璽綬以授桓玄。及桓玄敗亡，眾皆議誅之，惟劉裕獨力使其保全。
諸葛長民至豫州，因失期未及發兵，被桓玄部將刁逵擒獲。檻車未至，而桓玄敗亡。監送軍士遂放出葛長民，還趨於曆陽。
刁逵乃棄城而走，被部將捆送建康。劉裕下令斬於石頭城，子侄亦皆誅殺。
劉裕即克建康，複念劉牢之往日恩情，乃使人前往洛陽，召劉敬宣回來。
劉敬宣素曉天文星相，在洛陽見天象垂現，便知必有興複晉室者出，嘗告於家人道：桓玄必死，我等可歸鄉也。
這日夜間，又夢見自己搓土成丸服之。夢醒而大喜道：夫丸者，桓也。桓既被我吞服，則我當複歸本土耶！
恰好建康使者至，對劉敬宣說道：劉裕已滅桓玄，今命我召公回去。
劉敬宣遂與家人馳還建康，入見劉裕。
劉裕大喜，以劉敬宣為武岡縣侯，問道：我與劉毅共複晉室，卿謂我二人誰為雄傑？
劉敬宣笑道：明公天資英邁，賞罰嚴明，仁德兼備，實乃不世英雄，毅公何能及焉？況劉毅外寬而內忌，自伐而滿，若一旦與明公為敵，當曰陵上取禍，非可與明公同日共語。
劉裕聞其言大喜，由此而愈加自重。
鏡頭轉換，按下劉裕，複說晉帝。
當馮遷殺桓玄之時，晉尚書王暇與晉文帝乘於彆船，見馮遷行凶而去，於是率百官保護晉帝司馬德宗，複至江陵。
桓謙及桓振等初時兵敗逃竄，聞桓玄已死，複襲取江陵，殺北府軍守將王康產。桓振見晉文帝與百官皆處宮中，便欲弑殺皇帝，以為桓玄報仇。
桓謙諫止道：劉裕之亂，與皇帝何乾？若殺天子，則不容於天下，不如暫且囚禁。桓振從之，乃為桓玄舉哀發喪。
便在此時，何無忌與劉道規引北府兵至。桓謙出城迎敵，大敗回城。桓振大怒，親率兵出戰，戰於靈溪，何無忌敗歸潯陽。
劉敬宣在潯陽接應，進軍夏口。
桓振遣部將馮該守住長江東岸，孟山圖據住魯山城，桓仙客守偃月壘，水陸相援。
劉敬宣與何無忌見桓振如此而排，於是商量已定，以分兵夜襲之計，將三處壁壘悉數攻拔，並生擒孟山圖與桓仙客。
幸虧馮該見機跑得快，率殘部走奔石頭城去訖。
晉義熙元年正月，南陽太守魯宗之奉劉裕之命，引本部兵來襲襄陽。
襄陽守將桓蔚大懼，棄城奔走江陵。
北府將領劉毅引軍至馬頭，桓振恐不能守，遂挾晉安帝出屯江津，遣使來見劉毅，求割江、荊二州以降，願送天子還於建康，劉毅不許。
適逢魯宗之追擊桓蔚至江陵，進屯紀南。桓振遂留桓謙與馮該守江陵，自引兵五千來戰魯宗之。劉毅趁桓振出戰魯宗之，趁機大破馮該於豫章口，桓謙聞知棄城而走。
劉毅遂大驅三軍進入江陵，執卞範之等桓玄諸臣，儘行誅殺。
桓振大破魯宗之，勝利凱旋，但知江陵城陷，其眾皆潰，於是隻得引殘部逃於殞川。
劉毅既占江陵，終於解救出晉安帝，奉駕欲還建康。
晉帝詔命朝中大事皆委於劉毅處分，封為冠軍將軍，大赦改元，惟桓氏不赦。因桓衝靖忠王室有功，詔命特赦宥其孫桓胤，徙於新安。以魯宗之為雍州刺史，毛璩為征西將軍，督梁、益等五州軍事，弟毛瑾為梁、秦刺史，毛瑗為寧州刺史。
桓謙走投無路，降於秦帝姚興。
二月，留台百官備法駕迎晉安帝於江陵。劉毅與劉道規二人屯兵於夏口，以防備諸桓複來，使何無忌保晉安帝東還。
晉安帝至於建康。百官詣闕待罪，晉帝皆令官複原職。
尚書殷仲文奉帝升殿，遂以琅琊王司馬德文為大司馬，武陵王司馬遵為太何，劉裕為侍中、車騎將軍、都督中外諸軍事。
複欲加劉裕錄尚書事，劉裕固辭不受，而請歸京口藩鎮。
當初劉毅未得誌之時，曾為劉敬宣部下參軍，時人或以當世雄傑以許之。
劉敬宣道：此君外寬而內忌，自伐而矜人，若一旦得誌，必當陵上取禍。
有人卻將此言告知劉毅。此時劉毅既以救駕之功被封為冠軍將軍，猶且懷恨劉敬宣當初所說前言。又聞劉敬宣被封江州刺史，尤為忌恨。
乃使人進言於劉裕：劉敬宣未預複興之謀，授予州郡已然為過，況使為江州之主乎！
劉敬宣亦聞其奏，由是甚不自安，便遣人來見劉裕，自請解職歸田。劉裕不欲其與劉毅構隙，乃召還劉敬宣，使為宣城內史。
當時朝廷新定，風聞盧循欲為謀亂，劉裕未暇征討，便與百官商議。朝中文武厭倦征戰，皆讚成招安，於是朝廷詔命盧循為廣州刺史，任其部將徐道覆為始興相。
詔命下達，諸將皆勸盧循接受朝廷詔命。於是盧循貢獻朝廷，且贈劉裕以益智粽。
劉裕見其所贈，笑謂諸將：其欲我益智，是笑我無能也。
於是使人回贈以續命湯，意謂嘲其命短。盧循卻不知其中之意，猶疑不定。
盧循即受詔命為廣州刺史，乃引兵南下，攻陷番禺，擒執原廣州刺史吳隱之。盧循欲自用之，卻接劉裕來書，令其將吳隱之解送還京。盧循覽書，欲不聽從。
長史王誕諫道：當初漢末三國之時，孫伯符豈不欲留華子魚耶？因魏武帝曹操相召，不得不從，以一境不容二君故耳。
盧循聞而方悟，於是遣吳隱之還於建康，歸見劉裕。
又說益州刺史毛璩，聞桓振攻陷江陵，率眾三萬順流而下，欲親往征討。乃使其弟毛瑗兵出外水，參軍譙縱兵出涪水。
副將侯暉有反叛之心，借口梁州人不願東下，與巴西人陽昧勾結謀劃，在五城水口率部嘩變，並迫譙縱為盟主。
譙縱不肯聽從，縱身投江。侯暉將其救起，再三請求，以兵器逼迫譙縱坐於車駕回軍，在涪城襲擊毛璩弟西夷校尉毛瑾，並殺之。
譙縱此時騎上虎背，難得下來，便自稱梁、秦二州刺史。
毛璩到略城，聽說軍中叛亂，飛馬回歸成都，遣參軍王瓊率三千人征討譙縱，又派弟王瑗率領四千兵合後繼進。
譙縱派其弟譙明子及侯暉在廣漢抵禦，王瓊打敗侯暉，追到綿竹。
譙明子設兩路伏兵以待，大敗王瓊軍，益州官軍死亡者十之**。益州營戶李騰打開城門迎譙縱之兵，殺毛璩及其弟毛璦，屠滅全家。
毛璩死後，譙縱膽子便大了起來，於是自稱成都王，建立西蜀政權，命從弟譙洪為益州刺史，弟譙明子為鎮東將軍、巴州刺史，率徒眾五千人屯駐白帝城。
從此蜀中局勢大亂，漢中空虛，氐王楊盛便趁機遣其兄子楊撫入駐南鄭。
義熙元年春正月，廣州刺史盧循使司馬徐道覆寇略東陽，被建武將軍劉裕擊敗。鏡頭轉換，按下江南及西蜀皆亂，複說冀北。
慕容熙繼承慕容盛之位，在龍城自稱燕王。
鏡頭閃回。中山尹苻謨原是前秦皇族，迫於慕容垂軍強而投降後燕，任都城中山尹。
北魏軍南下之時，後燕惠湣帝慕容寶放棄中山城，逃亡和龍。
苻謨被開封公慕容詳殺害，家族慘遭屠殺。苻娀娥與苻訓英姐妹因當時不在中山城中，幸免於難，輾轉逃奔龍城，皆被慕容熙收納。
閃回結束。慕容熙既稱燕王，遂封苻娀娥為貴人，將苻訓英封為貴嬪。二女皆為慕容熙寵信，苻訓英尤其受到寵愛。
丁太後初與慕容熙有染，故竭力擁其繼位，此時見其喜新厭舊，過河拆橋，冷落自己，因此怨憤，便與親侄尚書丁信謀劃，欲廢黜慕容熙，改立章武公慕容淵為帝。
不料行事不秘，尚未發動便被宮人發覺，報於燕帝。
慕容熙正覺丁太後礙眼，於是借此逼迫，令其自殺，仍用皇後禮儀安葬。十一月戊辰，又斬殺丁後同黨慕容淵及丁信。
太後被殺，群臣大嘩。
其後慕容熙在龍城北郊打獵，石城令高和與宮廷庫衛在京城內發動叛亂。因襲殺司隸校尉張顯，衝入宮殿搶掠，取出庫中武器，脅迫軍營官署緊閉城門，占領城池。
慕容熙聞報，急率部眾飛馬回城，命開城門。城上未叛之軍打開城門，迎燕帝回城，將叛亂者全部誅殺，隻有高和逃走，免於一死。
光始三年，慕容熙立苻訓英為皇後，苻娀娥為昭儀。
苻氏姐妹極儘奢華，燕王慕容熙傾舉國之力應承，為二妃修建龍騰苑，方圓十餘裡，築景雲山於苑內，征發役徒二萬人。營建士卒不得休息，中暑而死者超過半數。
慕容熙出遊城南，在大柳樹下休息，忽聽樹中有人喊道：可止營造，可止營造！
遊目四顧，卻不見人。慕容熙令隨從伐其樹，不一刻樹斷，見有大蛇從樹中爬出，長丈餘，其後瞬息不見。
由此之後，後燕財富日漸枯竭，次年秋，苻娀娥患病而亡。
慕容熙大為悲痛，將為其診病諸醫全部車裂焚屍，其後更加寵愛苻訓英。
苻訓英喜歡獵遊，慕容熙相陪遠出數百裡，至數千護衛士卒凍死，或被虎狼所害。苻訓英愛食冬鮮地黃醮夏魚醬，廚吏難覓，慕容熙皆命殺之。
光始五年春，苻訓英隨慕容熙東征高句麗，兵臨遼東城下。
城將陷落，慕容熙命士卒先鏟平城牆，以便與皇後乘輦而入。由此延遲攻城時間，高句麗得以嚴備，故遼東城得全，燕軍铩羽而歸。
六年初，苻訓英又隨慕容熙北征契丹。
因見契丹兵盛，慕容熙意欲撤軍，苻訓英不從。慕容熙遂於二月棄其輜重，輕兵往襲高句麗，終至大敗而回。
光始七年，慕容熙為苻訓英修建新宮承華殿，令百官及軍士負土於北門，以致北城之土與米穀同價。夏四月癸醜，苻訓英作孽到頭，終於病逝。
慕容熙哀痛過度，決定為苻訓英修廟，強迫嫂高陽王妃張氏自殺，為苻訓英殉葬。複強迫官員為苻訓英哭喪，若不流涕者重罰，百官隻好用辛辣之物刺激雙目流淚。
苻訓英屍體收斂完畢，出城殯葬，因靈車過於高大，燕主遂令拆毀皇宮北門以出。
當時城中百姓見狀，皆謂此乃自毀門戶之舉，其國祚必將不久。
靈柩至於陵穴，慕容熙忽命開棺，扯開裹屍布以便再細看苻訓英樣貌。見其容貌如生，竟至情不自禁，親入棺與苻訓英之屍交配而出。
畫外音：以皇帝之尊當眾奸屍者，慕容熙乃有史以來第一人，亦唯獨一人，前無古人，後無來者。真是千古奇聞，驚豔全球！
皇後下葬次日，慕容熙尚未回宮，城中忽起暴亂。