他這個甘肅巡撫本來就在此次西征作戰中充當後勤負責人，相應的自然也要關注西域收複之後的安頓工作。而且，很顯然他看出了高務實讓他做這個甘肅巡撫的用意——現在是甘肅，將來卻要管西域。
西域收複於高務實秉政之時，第一任行政主官自然也必須出自實學派中，甚至更明確一點說，就是要出自「高黨」。這是毫無疑問的事，即便高務實不說，天下人對此也有所準備，而且並不會覺得過分。
熊廷弼的奏疏則專注於西域都護府的監察體係建設，建議設立專門的監察機構——察院，以確保都護府及其下屬機構的公正高效運作，並強調了監察機構與中央政府之間的信息流通和監督機製。
察院製度本身沒什麼奇怪，大明各省都是如此。隻不過熊廷弼將西域都護府的察院職能明確了不少，而且摻入了一些私貨。比如按照他奏疏中的說法，就明確了內閣對西域察院的監督權力。
要知道，大明各省的察院本質上隻是圍繞該省巡按禦史一人來運轉的，而巡按禦史這個職務相當特殊，他甚至不必向他所在的上級衙門——也就
是都察院負責。
沒錯，當禦史掛上了「巡按」名頭，就隻向皇帝本人負責。隻有當巡按禦史交卸巡按職責，重新回到都察院成為單純的監察禦史，才需要向都察院的主官左都禦史負責。
那麼如果西域將來的監察製度采用熊廷弼的建議，就會形成「都察院指導，內閣監督」的雙重領導體製——當然，理論上最終的決斷權還是在皇帝。然而眾所周知的是，一旦內閣也有了明確監督權，實際就一定會大大代替皇帝的直接管理——正如現在朝廷的行政權一樣，萬事都先經過內閣一手，皇帝在絕大多數情況下就隻能按照內閣的建議來決策。
漢弗萊爵士有過名言，大意是：我們要給首相幾個選項，讓首相覺得自己是可以選擇的。但選項裡有兩個選項意思差不多，剩下的一個選項則基本不可能實現，比如向法國宣戰或者轟炸華沙。
內閣同樣可以這般影響皇帝，比如給皇帝的建議有三個，其中兩個大差不差，另一個但凡是個正常人都不會選，於是皇帝大概率就隻能按照內閣的意思下旨。
不過話說回來，大明官場比大嚶官場多數情況下還略好一點。原因在於，大明內閣很少會被同一派人把持，而隻要有不同派係的閣老存在，雙方就可能內鬥，繼而很難完全操弄皇帝的思維。
好在，如今的內閣基本上是高務實的一言堂了……
說回監察製度。彆問為什麼內閣擁有監督權就成了領導西域巡按——看看大明巡撫的發展，巡撫一開始就是朝廷派往地方監督當地官員的，久而久之卻成了名正言順的領導該省三司的當地最大官員。
另外與王庭撰一樣，熊廷弼也猜到高務實會用他繼續做西域巡按禦史，因此他在奏疏末尾的說法也和王庭撰幾乎一樣。
三道奏疏擺在高務實麵前，他沉吟片刻，心中已有定奪。他知道，西域的戰事雖然取得了階段性的勝利，但真正的挑戰在於如何穩固這片新收複的土地，使其真正融入大明的版圖。
西域畢竟已經丟了六百多年，當地漢人根本找不到幾個，隻有行商之中還有一些，因此要想穩固下來確實有很多工作要做。
高務實決定，首先回複劉綎，指示其繼續完成對葉爾羌等地的收複，然後在確保葉爾羌、喀什噶爾、阿克蘇、和闐、哈密等關鍵地區穩固的前提下，暫時停止追擊，轉為防守態勢，以便集中精力鞏固已有的成果，並為後續的政治和經濟重建打下堅實基礎。
但於此同時，他也要求劉綎密切監視察哈爾、哈薩克乃至布哈拉等勢力的動向，做好隨時應對可能發生的變故的準備。
或者，一旦發現察哈爾部在安集延立足不穩，亦或者察哈爾部在攻下安集延之後又繼續對布哈拉其他地區發起了進攻，那麼也允許劉綎擁有高度自由的用兵權力，可以在戰機轉瞬即逝、來不及請求朝廷的情況下主動發起進攻，爭取拿下費爾乾納盆地。
當然，對於伊犁第一軍的建立，劉綎作為征西提督也有他該做的事……總之，劉綎的差事並沒有因為西域之戰基本結束而結束，反而變得更加複雜繁重起來。
對於王庭撰的奏疏，高務實認為其提出的策略全麵且切實可行，隻不過王庭撰這奏疏說得比較宏大，還不夠細致。高務實於是將這些建議整理成詳細的方案，準備提交給皇帝聖裁。對於王庭撰特彆強調設立西域都護府的重要性，以及在尊重當地習俗的基礎上推行漢文化的必要性，高務實也表示了肯定。
實際上關於西域收複之後要如何建製的問題，高務實之前就和皇帝有過討論，設立都護府算是其中一種設想。如今既然王庭撰和熊廷弼都認為設立都護府比較合理，高務實也就采納雅言了。
至於熊廷弼的建議，高務實也認為監察機構的建設至
關重要，他同意在西域都護府內設立察院，並賦予其必要的權限，以確保都護府的各項政策得到有效執行。
不過與此同時，他知道熊廷弼故意把一些話說得比較模糊，比如王庭撰提到要在西域各地錦衣衛站點，而熊廷弼就強調一切監察權都要歸察院——你們倆要是沒有「串供」才有鬼。
高務實毫不客氣地無視了這種刻意模糊，在給皇帝的建議中明確說錦衣衛必須與其他地區一樣，直接由錦衣衛都督或鎮撫使管理，而不能交給察院。
文官不能把所有權利都控製在手，否則將來必成禍患。現在有他高務實在，或許這些問題都能被壓製，但如果他不在了呢？絕對的權力一定會讓文官集團隻手遮天，然後變成和原曆史上的文官集團一樣，把個朝廷玩得稀爛。
票擬送到司禮監不到一個時辰，司禮監掌印大太監陳矩便親自來了內閣，傳達皇帝口諭：宣大學士高務實西暖閣覲見。
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