大明營兵製始終處在不成熟狀態，儘管不斷發展，不斷調整，可惜始終未能成功。
還是鬆錦之戰，曹變蛟為東協總兵，東協負責山海、石門、燕河、建昌四路，馬科為山海關總兵，彼此軍隊卻互不統屬。
清朝，綠營兵製則是對明代營兵製的直接繼承，徹底擺脫衛所的掣肘。
思索良久，朱由校本欲效仿綠營製施行養兵製，奈何朝廷沒有改變存留起運銀分配模式，即使戶部，內帑現銀不少，但招架不住百萬大軍，動輒數千萬的軍餉。
所以，他打消這個念頭。
朱由校揉了揉鬢角，抬頭挺胸端坐，輕咳兩聲停止百官討論，擲地有聲說：“朕計劃廢都指揮使，改為提督，將總兵和都指揮使互不隸屬，改為總兵隸屬提督。提督，總兵，皆為常設官。
因總兵所轄的君鎮大小，重要程度各不相同，故而兵力不做平均分配。
九邊軍鎮的總兵，每人統帥六到十個衛，獨立領三到五個衛，在能戰的軍戶內選兵，騎兵拔於步戰兵，步戰兵拔於守兵，守兵拔於餘丁，無餘丁乃募於民。
總兵下設兩名副總兵，四名參將，八個遊擊，十六個都司，都司都為營軍官，步軍營，騎兵營人數為滿員千戶所，火器營滿員千五百人。
不重要的鎮，總兵統領一衛或一所。
同時，提督以下將領隻有統兵權，而無調兵權，兵權歸於朝廷，提督軍令受巡撫節製，巡撫有直屬親衛，以陝西為例，陝西巡撫控西安四衛。”
“當前，提督為從一品，統帥所屬衛所官兵，為一省衛所最高級軍官，總兵因其領兵不同，品階為正五品到正二品。
另設，外海﹑內河﹑長江﹑福建﹑廣東水師亦設提督，隸屬三大水師。凡水陸提督統轄所屬官兵﹐各司其職﹐分防要地﹐或遊弋巡哨﹐修整武備﹐皆受樞密院大總督節製。”
朱由校道出自己的建議，目光灼灼望向文武百官。
頃刻，百官好似沸騰的開水炸鍋了。
皇帝采納百官建議，擴大總兵領兵人數，但步子邁得太大，若某位總兵領十衛，則控五萬四千名兵勇，獨立領五個衛，則是兩萬七千兵勇。
這還好，其受巡撫節製。
然而，三邊總督呢。
三邊總督控製延綏、寧夏、甘州和固原四大軍鎮，各鎮總兵，各地巡撫均受其節製。
受其節製的各路兵馬超過三十萬，失去控製很容易養虎為患。
孫承宗神色著急，作揖直言進諫：“陛下安排臣基本無異議，然延綏、寧夏、甘州和固原受三邊總督節製，其統領的軍隊是否太多，萬一形成地方割據，朝廷尾大難處，望陛下三思，謀定而後動，加強對三邊總督限製。”
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